板蓝根并不是“圣药”，只能在一定程度上增强人体自身的免疫力。由于板蓝根具有抗病毒、清热解毒的作用，并且副作用很小，所以在流感期间服用板蓝根可以在一定程度上增强免疫力和抗病毒能力。当人体免疫力各方面都处于良好状态时，预防和治疗病毒感染的效果也会比一般体质较弱的人好。
板蓝根是菘蓝属2年生植物的根茎部分，叶子也被称为大青叶，同样具有清热解毒的作用。板蓝根中含有多种氨基酸、谷甾醇、靛青、靛玉红等药用成分，对多种细菌性和病毒性疾病如流感、流脑、腮腺炎、钧端螺旋体病、肺炎、肝炎等有良好的预防和治疗效果。
从药理学的角度来看，板蓝根的毒副作用很小，因为它是一种“解毒”药物，所以容易被人们误认为无毒。然而，如果长时间大剂量使用，在肝脏的解毒能力下降时，就会造成中毒。
出现消化系统和造血系统的损害，例如上消化道出血、白细胞减少等。这种情况在儿童中更容易出现，原因是他们的肝脏功能不完善，解毒酶的含量不足，同时用药剂量也较难掌握。一旦出现毒副作用，应立即停止使用并立即就医。
另外，对于对板蓝根过敏的人，需要避免使用该药。大多数过敏反应是由板蓝根注射液引起的，表现为头晕眼花、气短、呕吐、心慌和皮疹，有时还出现全身多形红斑型药疹，严重者可能会有血压下降，甚至出现过敏性休克，如果抢救不及时可能危及生命。
最后，板蓝根并不是万能药，也不能治愈所有疾病。从药物的性质来看，它属于寒凉的品性，所以适用于实热的症状。对于年老体弱、脾胃虚寒的人来说，长期大量使用板蓝根会进一步削弱他们的体质，并且可能会出现口淡、疲乏等症状。